Amidaza (AMD)
Fermentlar:Makromolekulyar biologik katalizatorlar, aksariyat fermentlar oqsillardir
Amidaza:Asil guruhini suvga o'tkazib, erkin kislotalar va ammiak hosil qilish orqali turli endogen va begona alifatik va aromatik amidlarning gidrolizini katalizlang. Gidroksamik kislotalar va boshqa organik kislotalar o'sish omillari, antibiotiklar va o'sma ingibitorlarining tarkibiy qismi bo'lgani uchun dori sifatida keng qo'llaniladi. Amidazalarni katalizator stereoselektivligiga ko'ra R tipidagi va S tipidagi atsilazalarga bo'lish mumkin.
Amidaza amidlarning gidrolizini katalizlashdan tashqari, gidroksilamin kabi qo'shma substratlar ishtirokida atsil uzatish reaksiyalarini ham katalizlashi mumkin.
Turli manbalarga ega amidaza substratning o'ziga xosligi bilan farq qiladi, ularning ba'zilari faqat aromatik amidlarni gidrolizlay oladi, ba'zilari faqat alifatik amidlarni gidrolizlay oladi, ba'zilari esa α-yoki ω-amino amidlarni gidrolizlay oladi. Ko'pgina aminlar faqat asiklik yoki oddiy aromatik amidlar uchun yaxshi katalitik faollikka ega, ammo murakkab aromatiklar uchun heterosiklik amidlar, ayniqsa orto o'rinbosarlari bo'lgan amidlar, odatda past faollikka ega (faqat bir nechta fermentlar yaxshiroq katalitik ta'sir ko'rsatadi).
Katalitik mexanizm:
| Fermentlar | Mahsulot kodi | Mahsulot kodi |
| Ferment kukuni | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 ta amidaza to'plami, har biri 50 mg, 19 ta mahsulot * 50 mg / mahsulot yoki boshqa miqdor |
| Skrining to'plami (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 ta amidaza to'plami, har biri 1 mg, 19 ta mahsulot * 1 mg / mahsulot |
★ Yuqori substrat o'ziga xosligi.
★ Kuchli xiral selektivlik.
★ Yuqori konversiya samaradorligi.
★ Kamroq qo'shimcha mahsulotlar.
★ Yengil reaksiya holatlari.
★ Ekologik toza.
➢ Substratning o'ziga xosligi tufayli ma'lum substratlar uchun ferment skriningi o'tkazilishi va maqsadli substratni eng yaxshi katalitik ta'sir bilan katalizlaydigan ferment olinishi kerak.
➢ Hech qachon yuqori harorat, yuqori/past pH va yuqori konsentratsiyali organik erituvchi kabi ekstremal sharoitlarga tegmang.
➢ Odatda, reaksiya tizimi substrat, bufer eritmasini (fermentning optimal reaksiya pH qiymati) o'z ichiga olishi kerak. Asil uzatish reaksiya tizimida gidroksilamin kabi qo'shma substratlar mavjud bo'lishi kerak.
➢ AMD optimal reaksiya pH va haroratiga ega reaksiya tizimiga oxirgi marta qo'shilishi kerak.
➢ Barcha turdagi AMD turli xil optimal reaksiya sharoitlariga ega, shuning uchun ularning har birini alohida o'rganish kerak.
1-misol(1):
Turli amid substratlariga gidroliz faolligi
| Substrat | Muayyan faoliyat μmols min-1mg-1 | Substrat | Muayyan faoliyat μmols min-1mg-1 |
| Asetamid | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butyramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0.8 |
| Izobutiramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0.3 |
| Pentanamid | 22.0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Geksanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1.7 |
| Siklogeksanamid | 19.5 | Izonikotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrilamid | 3.5 | 3-Fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | Indol-3-asetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reaksiya 50 mM natriy fosfat bufer eritmasida, pH 7,5 da, 70 ℃ da amalga oshirildi.
| Amidlar | Gidroksilamin | Gidrazin |
| Asetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| Izobutiramid | 25.0 | 22.7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reaksiya 50 mM natriy fosfat bufer eritmasida, pH 7,5 da, 70 ℃ da amalga oshirildi.
Tegishli reagent konsentratsiyasi: amidlar, 100 mM (benzamid, 10 mM); gidroksilamin va gidrazin, 400 mM; ferment 0,9 mkM.
2-misol(2):
3-misol(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., va boshqalar. Ekstremofillar, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR va boshqalar. Jarayonlar biokimyosi, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM va boshqalar. Bioorganik kimyo, 2017, Onlayn mavjud 7.
