Amidaza (AMD)
Fermentlar:Makromolekulyar biologik katalizatorlar, aksariyat fermentlar oqsillardir
Amidaza:Erkin kislotalar va ammiak ishlab chiqarish bilan asil guruhini suvga o'tkazish orqali turli endogen va begona alifatik va aromatik amidlarning gidrolizini katalizlang.Gidroksamik kislotalar va boshqa organik kislotalar dori sifatida keng qo'llaniladi, chunki ular o'sish omillari, antibiotiklar va o'simta ingibitorlari tarkibiga kiradi.Amidazalar katalizatorning stereoselektivligiga ko'ra R tipidagi va S tipidagi asilazaga bo'linishi mumkin.
Amidaza amidlarning gidrolizlanishini katalizlashdan tashqari, gidroksilamin kabi ko-substratlar ishtirokida asil o'tkazish reaktsiyalarini ham katalizlashi mumkin.
Turli manbalarga ega amidaza turli xil substrat o'ziga xosligiga ega, ularning ba'zilari faqat aromatik amidlarni, ba'zilari faqat alifatik amidlarni, ba'zilari esa a- yoki ō-aminoamidlarni gidrolizlaydi.Ko'pgina aminlar faqat asiklik yoki oddiy aromatik amidlar uchun yaxshi katalitik faollikka ega, ammo murakkab aromatiklar uchun geterotsiklik amidlar, ayniqsa orto o'rnini bosuvchi amidlar odatda past faollikka ega (faqat bir nechta fermentlar yaxshiroq katalitik ta'sir ko'rsatadi).
Katalitik mexanizm:
| Fermentlar | Mahsulot kodi | Mahsulot kodi |
| Ferment kukuni | ES-AMD-101 ~ ES-AMD-119 | 19 ta amidaza to'plami, har biri 50 mg 19 ta element * 50 mg / mahsulot yoki boshqa miqdor |
| Skrining to'plami (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 ta amidaza to'plami, har birida 1 mg 19 ta element * 1 mg / element |
★ Yuqori substrat o'ziga xosligi.
★ Kuchli chiral selektivlik.
★ Yuqori konversiya samaradorligi.
★ Qo'shimcha mahsulotlar kamroq.
★ Yengil reaksiya sharoitlari.
★ Ekologik toza.
➢ Substratning o'ziga xosligi tufayli ma'lum substratlar uchun ferment skriningi o'tkazilishi va eng yaxshi katalitik ta'sirga ega bo'lgan maqsadli substratni katalizlaydigan fermentni olish kerak.
➢ Hech qachon ekstremal sharoitlar bilan aloqa qilmang: yuqori harorat, yuqori/past pH va yuqori konsentratsiyali organik erituvchi.
➢ Odatda, reaktsiya tizimi substrat, bufer eritmasini o'z ichiga olishi kerak (fermentning optimal reaktsiyasi pH).Hidroksilamin kabi ko-substratlar asil uzatish reaktsiyasi tizimida bo'lishi kerak.
➢ AMD optimal reaksiya pH va harorati bilan reaksiya tizimiga oxirgi marta qo'shilishi kerak.
➢ AMD ning barcha turlari turli xil optimal reaktsiya sharoitlariga ega, shuning uchun ularning har biri alohida o'rganilishi kerak.
1-misol(1):
Turli amid substratlarga gidroliz faolligi
| Substrat | Maxsus faoliyat mkmol min-1mg-1 | Substrat | Maxsus faoliyat mkmol min-1mg-1 |
| Asetamid | 3.8 | ο- OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p- OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butiramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| Izobutiramid | 26.2 | ο- Toluamid | 0.3 |
| Pentanamid | 22.0 | p- Toluamid | 8.1 |
| Geksanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1.7 |
| Siklogeksamid | 19.5 | Izonikotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrilamid | 3.5 | 3-fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | Indol-3-asetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reaksiya 50 mM natriy fosfat bufer eritmasida, pH 7,5, 70 ℃ da amalga oshirildi.
| Amidlar | Gidroksilamin | Gidrazin |
| Asetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| Izobutiramid | 25.0 | 22.7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reaksiya 50 mM natriy fosfat bufer eritmasida, pH 7,5, 70 ℃ da amalga oshirildi.
Tegishli reaktiv konsentratsiyasi: amidlar, 100 mM (benzamid, 10 mM);gidroksilamin va gidrazin, 400 mM;ferment 0,9 mkM.
2-misol(2):
3-misol(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., va boshqalar.Ekstremofillar, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR va boshqalar.Jarayon biokimyosi, 2015, 50 (8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM va boshqalar.Bioorganik kimyo, 2017, Internetda mavjud 7.
